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中國國家數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)(免費大數(shù)據(jù)分析網(wǎng)站)
大家好!今天讓創(chuàng)意嶺的小編來大家介紹下關于中國國家數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)的問題,以下是小編對此問題的歸納整理,讓我們一起來看看吧。
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本文目錄:
一、數(shù)字中國落地的必要條件是什么?
數(shù)字化基礎設施的完善是數(shù)字中國落地的必要條件。
數(shù)字中國旨在以遙感衛(wèi)星圖像為主要的技術分析手段,在可持續(xù)發(fā)展、農(nóng)業(yè)、資源、環(huán)境、全球變化、生態(tài)系統(tǒng)、水土循環(huán)系統(tǒng)等方面管理中國。
為加快“數(shù)字中國”建設,中國政府開展了很多工作,包括積極實施“互聯(lián)網(wǎng)+”行動,推進實施“寬帶中國”戰(zhàn)略和國家大數(shù)據(jù)戰(zhàn)略等。此外,還將啟動一批戰(zhàn)略行動和重大工程,推進5G研發(fā)應用,實施IPv6規(guī)模部署行動計劃等。
建設數(shù)字中國的基礎條件
一、全國公民身份信息數(shù)字庫建成
全國近13億人口身份數(shù)據(jù)已于2006年底全部入庫,世界最大的人口身份信息數(shù)據(jù)庫“全國公民身份信息系統(tǒng)”正式建成。
二、我國信息基礎設施建設初具規(guī)模
初步完成國家數(shù)據(jù)中心建設,建立了四個省級數(shù)據(jù)分中心。依托數(shù)據(jù)中心建設的數(shù)據(jù)容災備份中心和安全認證中心正在規(guī)劃中。全國國民信息網(wǎng)絡體系框架初步建立,基本實現(xiàn)中央與各省內的網(wǎng)絡連接。各部委機關的局域網(wǎng)建設已經(jīng)完成。
三、個人網(wǎng)絡應用已經(jīng)發(fā)展到了新階段
互聯(lián)網(wǎng)已成為人民大眾工作、生活不可或缺的工具和平臺。截至2010年底,我國網(wǎng)絡購物用戶規(guī)模達到1.61億人,有3.75億人通過搜索引擎查詢各類信息,3.53億人通過即時通信工具溝通,還有2.95億人通過博客發(fā)布各類信息和觀點。
四、行業(yè)信息化應用體系初步形成
互聯(lián)網(wǎng)在社會公共服務領域發(fā)揮越來越重要的作用。隨著云計算、物聯(lián)網(wǎng)等技術在醫(yī)療、交通等領域的應用,公共服務的手段和平臺將進一步豐富和延伸,促進社會服務管理模式的創(chuàng)新發(fā)展。
電子政務建設的一大目標,就是幫助政務部門更好地履行職能,實現(xiàn)各種政務信息的上傳下達,從而更好地提升工作效率,促進經(jīng)濟社會發(fā)展。其中,對于信息資源的采集、更新、公開與共享來說,信息流轉的暢通是基礎。從我國信息化建設的發(fā)展來看,網(wǎng)絡往往是系統(tǒng)建設的基礎。
五、信息化標準規(guī)范建設及基礎性研究日益加強
信息標準規(guī)范研究取得初步進展,行業(yè)標準規(guī)范體系框架基本建立。一系列信息化標準技術規(guī)范已正式頒布實施。我國的數(shù)據(jù)庫研究、管理動態(tài)信息系統(tǒng)和預警系統(tǒng)論證研究等一批重點課題完成。
六、信息化工作機構與人才隊伍建設取得成效
國家信息化領導小組是為了進一步加強對推進我國信息化建設和維護國家信息安全工作的領導,于2001年8月由中共中央、國務院重新組建而成。國家信息化領導小組的具體工作由工業(yè)和信息化部承擔。通過信息化重點項目實施,全國初步形成了一支信息化建設專業(yè)隊伍,信息化應用環(huán)境得到顯著改善。
七、統(tǒng)一平臺、資源共享、以人為本的理念已成共識
近幾年來,中國電子政務建設中的一個重要特征就是縱向、局部信息化的應用需求強勁。這些以部門、地區(qū)為代表的信息化應用,對于提高行政效率,促進國民經(jīng)濟的發(fā)展,都產(chǎn)生了深刻影響。
二、統(tǒng)計局數(shù)據(jù)中心怎么樣
還不錯。統(tǒng)計局數(shù)據(jù)中心待遇好,人員平均工資5000-8000不等,有交通補助,飯補,電話費補助,繳納五險、公司周圍交通便利,餐飲方便。中華人民共和國國家統(tǒng)計局成立于1952年8月。統(tǒng)計,是國家管理和科學決策的一項重要基礎性工作。宗旨是及時、準確地發(fā)布最新、最全面的統(tǒng)計信息。
三、國家基因組科學數(shù)據(jù)中心怎么用
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國家基因組科學數(shù)據(jù)中心(NGDC)---組學原始數(shù)據(jù)如何上傳GSA 原創(chuàng)
2022-04-25 14:44:31
sisichen �
碼齡4年
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文章目錄
前言
一、什么是NGDC?
二、NGDC的發(fā)展歷程
三、什么是GSA?
四、為什么選擇上傳數(shù)據(jù)到GSA?
五、如何上傳測序原始數(shù)據(jù)至GSA?(重點!!附詳細步驟?。。?/p>
1. 準備要上傳的數(shù)據(jù)
2. 計算MD5碼
3.進入NGDC主頁,登入賬戶
4. 填寫數(shù)據(jù)信息
第一步:建立Bioproject。
第二步:建立BioSample。
第三步:創(chuàng)建GSA。
進入GSA數(shù)據(jù)庫
新建GSA
填寫信息
下載表格文件
5. 數(shù)據(jù)上傳:
(1). 通過FTP軟件 上傳(上傳需要流量??!如果小數(shù)據(jù)可以用)
(2). 通過服務器上傳(推薦!?。?如果實驗室有服務器的話,推薦服務器上傳,步驟如下:(服務器上要先安裝ftp )
(3)郵寄硬盤
6.等待審核
總結
前言
在發(fā)表文章之前我們需要將測序的原始數(shù)據(jù)上傳到一個公共庫,并在文中提供accession number,實現(xiàn)數(shù)據(jù)的公開共享,這是國際慣例。以前我們上傳數(shù)據(jù)時只能上傳到美國國立生物技術信息中心(NCBI)、歐洲生物信息學研究所(EBI)、日本核酸數(shù)據(jù)庫(DDBJ),現(xiàn)在中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)國家基因組科學數(shù)據(jù)中心 (CNCB-NGDC)—中國的 “NCBI” 已經(jīng)建立并日漸完善。組學原始數(shù)據(jù)歸檔庫(GSA)是組學原始數(shù)據(jù)匯交、存儲、管理與共享系統(tǒng),是國內首個被國際期刊認可的組學數(shù)據(jù)發(fā)布平臺。GSA已獲得多個國際期刊認可,并已被國際著名出版商Elsevier收錄為指定的基因數(shù)據(jù)歸檔庫,其權威性得到國內外100余家學術雜志的認可。GSA已通過FAIRsharing認證,獲得Wiley出版集團認可,因此我們不用擔心上傳數(shù)據(jù)到GSA不被期刊認可,也不用再舍近求遠上傳數(shù)據(jù)到NCBI,作為中國人,我們一定要支持我們NGDC中的數(shù)據(jù)庫。本文介紹了如何上傳測序原始數(shù)據(jù)到GSA,附詳細操作步驟。
一、什么是NGDC?
國家基因組科學數(shù)據(jù)中心(https://ngdc.cncb.ac.cn/;NGDC)于2019年6月5日經(jīng)科技部、財政部通知公布,由鮑一明研究員作為學術帶頭人,以中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)作為依托單位,聯(lián)合中國科學院生物物理研究所和中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所共同建設。中心面向我國人口健康和社會可持續(xù)發(fā)展的重大戰(zhàn)略需求,建立生命健康組學大數(shù)據(jù)儲存、整合與挖掘分析研究體系,研發(fā)生物多樣性與健康大數(shù)據(jù)匯交、應用與共享平臺,發(fā)展大數(shù)據(jù)系統(tǒng)解析與轉化應用的新技術和新方法,建設支撐我國生命科學發(fā)展、國際知名的基因組科學數(shù)據(jù)中心。
2020年中心開發(fā)了8個全新數(shù)據(jù)庫 (2019nCoVR,Aging Atlas,BrainBase,CGIR,GTDB,LncExpDB,scMethBank和TransCirc),更新和豐富了多個核心數(shù)據(jù)庫資源 (BioProject,BioSample,GSA,GWH,GVM,GEN和生物多樣性資源等),涉及疾病、衰老、調控和生物多樣性等多個前沿領域,初步形成我國生物數(shù)據(jù)安全匯交管理和多組學數(shù)據(jù)平臺的國家中心數(shù)據(jù)資源體系。數(shù)據(jù)庫建設整體情況以“Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021”為題在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發(fā)表。
NGDC的主要致力于以下三方面的工作:①圍繞中國人群普惠健康的精準醫(yī)學相關組學信息資源,完善建立中國人群基因組遺傳變異圖譜,形成中國人群精準醫(yī)學信息庫;②基于高通量測序的海量原始組學數(shù)據(jù)資源,建立符合國際標準的原始組學數(shù)據(jù)歸檔庫,形成中國原始組學數(shù)據(jù)的共享平臺;③圍繞國家重要戰(zhàn)略生物資源,建立海量組學數(shù)據(jù)的整合、挖掘與應用體系,形成綜合性的多組學數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。
在這里插入圖片描述
常用資源:
生物項目數(shù)據(jù)庫(BioProject):是收集與共享生物學研究項目信息的資源庫,涵蓋的項目類型包括常規(guī)組學研究的基因組、轉錄組、表觀組和宏基因組等,并針對大型項目提供高效、安全、專業(yè)化的項目分級管理。
生物樣本數(shù)據(jù)庫(BioSample):是收集與與共享生物樣品信息的資源庫,提供生物樣品單結構化描述信息遞交和發(fā)布,涵蓋的樣品類型包括人、動物、植物、微生物(含環(huán)境微生物)、病毒等,提供批量數(shù)據(jù)上傳和離線數(shù)據(jù)遞交服務。通常一個BioProjiect對應一個BioSample,如果多個樣本可以批量設置BioSample,也就是一個BioProject對應多個Biosample。
組學原始數(shù)據(jù)歸檔庫(GSA):植物/動物
組學原始數(shù)據(jù)歸檔庫 (GSA-Human):人類遺傳資源數(shù)據(jù),需要備案
多元數(shù)據(jù)歸檔庫(OMIX):如要共享的代謝組數(shù)據(jù),影像,Excel等,上述兩個庫不能存放的,上傳到這個庫。
生物工具庫(Biocode):存放代碼,部分替代github
基因組序列數(shù)據(jù)庫(GWH):類似于NCBI 的genebank, 基因組拼接組裝完的數(shù)據(jù)可以上傳到這里
基因組變異庫(GVM):等同于NCBI DDSNP(19年后只接受人的),包括人動物作物的單核苷酸多態(tài)性變異,call SNP 變異的數(shù)據(jù)上傳這里
生物數(shù)據(jù)庫目錄(DBCommons ):根據(jù)引用(平均年引用)評價一些數(shù)據(jù)庫,如DVide和KEGG等
基因表達數(shù)據(jù)庫(GEN):等同于國際上的GO
甲基化數(shù)據(jù)庫(MethBank)
二、NGDC的發(fā)展歷程
生物信息的數(shù)據(jù)要海量整合后才會有價值,割裂的數(shù)據(jù)庫只完成了“存”卻難以走向“使用”, 為了解決我國基因組數(shù)據(jù)存管用難、數(shù)據(jù)流失嚴重、核心基因組科學信息資源先“出口”再“進口”的問題,國家基因組科學數(shù)據(jù)中心應運而生。從2016年到2022年,短短6年的時間,NGDC已經(jīng)發(fā)展成為全球主要的生物數(shù)據(jù)中心。
在這里插入圖片描述
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三、什么是GSA?
組學原始數(shù)據(jù)歸檔庫(Genome Sequence Archive,簡稱GSA)是組學原始數(shù)據(jù)匯交、存儲、管理與共享系統(tǒng),是國內首個被國際期刊認可的組學數(shù)據(jù)發(fā)布平臺, 主要匯交實驗信息(Experiment Metadata)、測序反應信息(Run Metadata)信息以及歸檔測序文件數(shù)據(jù)(Sequence Data file)。
GSA的系統(tǒng)建設遵循了國際核酸序列共享聯(lián)盟(InternationalNucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)的相關標準,并作為INSDC的補充,旨在減輕國際相關數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)存貯及數(shù)據(jù)傳輸?shù)膲毫?;立足中國,服務全球。由于中國國際網(wǎng)絡出口帶寬的瓶頸問題,數(shù)據(jù)傳輸效率低下。以中國科學院北京基因組研究所的150Mbs出口帶寬為例,向NCBI數(shù)據(jù)庫遞交1TB的數(shù)據(jù)需要花費2周以上的時間。GSA的建立可以讓國人享受更快的傳輸速度,更貼心的服務!
截至2022年4月,GSA已為國內外多個單位提供免費數(shù)據(jù)存儲服務,累計用戶遞交項目信息超過572,259個,用戶提交的測序數(shù)據(jù)量超過13.23PB。
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四、為什么選擇上傳數(shù)據(jù)到GSA?
上傳GSA數(shù)據(jù)庫的幾大理由:
1.符合數(shù)據(jù)戰(zhàn)略安全要求;
2. 是國內首個被國際期刊認可的組學數(shù)據(jù)發(fā)布平臺;
3.界面可切換為中文,契合大家閱讀習慣;
4.人性化設置,例如公布日期可隨時修改,數(shù)據(jù)未公開前可一鍵分享給審稿人查看,數(shù)據(jù)上傳信息修改、增添方便等等;
5.多途徑協(xié)助數(shù)據(jù)上傳, 上傳數(shù)據(jù)快 (qq群全天候解答疑問,優(yōu)盤寄送或工作人員上門拷貝等綠色上傳通道)。
3. GSA立足于中國,極大方便了中國科學家的數(shù)據(jù)遞交,同時遵循INSDC聯(lián)盟數(shù)據(jù)標準,立心于服務全球,為全世界的科研領域共享貢獻數(shù)據(jù)。
簡單來說就是:有底氣、被認可、更快、更方便
五、如何上傳測序原始數(shù)據(jù)至GSA?(重點?。「皆敿毑襟E?。。?/p>
1. 準備要上傳的數(shù)據(jù)
原始數(shù)據(jù),fastq、bam文件,網(wǎng)站只接受gzip和bzip2壓縮格式
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2. 計算MD5碼
MD5碼主要是用來校驗遞交的數(shù)據(jù)在網(wǎng)絡傳輸過程中是否損壞或丟包,它是由數(shù)字和英文字母組成的長度為 32 的定長字符串,一般測序公司返回的數(shù)據(jù)中會有。我們也可以通過以下方式進行計算MD5碼:
Linux 用戶使用 $ md5sum 命令計算;(輸入md5sum 加文件名)
代碼如下(示例):
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Mac 用戶使用$ md5 命令計算;
Windows 用戶使用第三方工具進行計算,例如 winmd5free。
3.進入NGDC主頁,登入賬戶
首先進入我們NGDC主頁:(https://ngdc.cncb.ac.cn/)–點擊登入;
在這里插入圖片描述如果是第一次使用要注冊賬戶:
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4. 填寫數(shù)據(jù)信息
賬戶注冊完以后,就可以登入賬戶按照以下原則進行數(shù)據(jù)信息錄入。簡單來說就是填寫你要上傳數(shù)據(jù)的信息,分為以下三步①先創(chuàng)建BioProject ②創(chuàng)建BioSample ③創(chuàng)建GSA(先創(chuàng)建experiment 再創(chuàng)建run)。只填寫*的必填部分即可??赡艽蠹也惶斫釨ioProject, BioSample,experiment, run。舉個例子,假如我有以四個時間點Ck,12h,24h,48h,每個時間點三個生物學重復,取樣測的轉錄組數(shù)據(jù)。那么我就有12個樣本BioSample,12個experiment,12個run,或者一個experiment對應多個run也可以。
四、中國電信云網(wǎng)集成和數(shù)據(jù)遷移有什么優(yōu)勢
近日,國家發(fā)展改革委、中央網(wǎng)信辦、工業(yè)和信息化部、國家能源局聯(lián)合印發(fā)通知,同意在全國8地啟動建設國家算力樞紐節(jié)點,并規(guī)劃了10個國家數(shù)據(jù)中心集群。
中國電信集團有限公司副總經(jīng)理劉桂清介紹,中國電信全面推進云改數(shù)轉戰(zhàn)略,一直高度重視和積極參與全國一體化大數(shù)據(jù)中心體系總體布局設計,積極響應國家號召,圍繞“數(shù)網(wǎng)”“數(shù)紐”“數(shù)鏈”“數(shù)腦”“數(shù)盾”五大要素,加快數(shù)據(jù)中心布局、算力調度體系、數(shù)據(jù)流通、數(shù)據(jù)應用、安全能力建設。
當前“東數(shù)西算”工程正式全面啟動,將有利于中國電信充分發(fā)揮云網(wǎng)融合優(yōu)勢,進一步優(yōu)化中國電信的算力資源布局,進一步降低數(shù)據(jù)中心的運營成本,推動信息基礎設施布局進一步完善。從算力資源布局角度,全國一體化大數(shù)據(jù)中心體系建設,將推動業(yè)務需求和各類建設條件向八大節(jié)點集中,因此將進一步推動中國電信的算力資源向核心區(qū)域集約布局,使得資源配置更加精準,資源利用更加高效,有效彌補東部資源的不足。同時,充分盤活西部資源,從降低運營成本角度。一直以來,數(shù)據(jù)中心的能耗高居不下,2021年11月國家發(fā)改委印發(fā)的《關于嚴格能效約束推動重點領域節(jié)能降碳的若干意見》將數(shù)據(jù)中心定位為高能耗產(chǎn)業(yè),以中國電信為例,2021年數(shù)據(jù)中心耗電達到56億度,占總耗電量的20%。
此次一體化大數(shù)據(jù)中心布局要求能源網(wǎng)和算力網(wǎng)高效協(xié)同,將在一定程度上降低運營成本;從推動信息基礎設施布局角度,全國一體化大數(shù)據(jù)中心與傳統(tǒng)數(shù)據(jù)中心不同,是將數(shù)據(jù)中心、通信網(wǎng)、云計算、大數(shù)據(jù)、人工智能和安全等融為一體,從而構建新型的信息基礎設施體系。
中國電信在2020年明確提出,按照“網(wǎng)是基礎、云為核心、網(wǎng)隨云動、云網(wǎng)一體”的原則,打造云網(wǎng)融合、安全綠色的新型信息基礎設施,其核心內容與一體化大數(shù)據(jù)中心體系的要求完全吻合。
中國電信擁有794個數(shù)據(jù)中心,機架50萬個。按照2+4+31+X的結構進行全國布局,該布局與全國一體化大數(shù)據(jù)中心的國家樞紐節(jié)點的選址、業(yè)務定位以及核心集群與城市數(shù)據(jù)中心的分類高度吻合。其中2指在內蒙、貴州兩個樞紐的內蒙古和貴州數(shù)據(jù)中心園區(qū),定位為全國數(shù)據(jù)存儲備份、離線分析的基地;4為京津冀、長三角、粵港澳大灣區(qū)和成渝四個樞紐的布局,定位為熱點地區(qū)高密度人口高頻次訪問的視頻播放、電子商務等實時要求較高的業(yè)務承載;31+X為包括甘肅、寧夏兩個樞紐在內的為31省及X個重點城市的布局,重點定位為車聯(lián)網(wǎng)、自動駕駛、無人機、工業(yè)互聯(lián)網(wǎng)、AR\VR等超低延遲、大帶寬、海量連接的業(yè)務。
以上就是關于中國國家數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)相關問題的回答。希望能幫到你,如有更多相關問題,您也可以聯(lián)系我們的客服進行咨詢,客服也會為您講解更多精彩的知識和內容。
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